生物制药工业是污染大户，其排出废水中不仅有机污染物浓度高，而且含有抑制微生物生长的各种因素，采用通用的废水处理技术就可以取得良好的处理效果。生物制药工业是以粮食为原料，发酵培养特定药用微生物，发酵液经过压滤后滤液可用化学手段提取。在制药过程中主要有两类废水：发酵废水和提取废水。发酵废水中混有发酵残渣和微生物菌等，悬浮物含量高，对某些微生物有较强的抑制作用。加入混凝剂可使悬浮物沉淀下来，清液对微生物的抑制性明显降低。提取废水是滤清液用化学方法提出药物成分后的废水。水中含有提取中加入的化学物质，其有些物质可抑制产微生物生长。生物制药污水处理流程一般是污水经排污阀门控制流入格栅集水井后，由泵打入预曝调节池，经气泵充氧微孔曝气器曝气后由泵打入塔式气浮装置。在未进入气浮池前，混入已配置好的药液，并在特定PH值区间进行混凝气曝，气浮罐打入由空压机与溶气罐溶气好的溶气水，经与罐内释放器骤然降低压力的情况下，放出无数微小气泡，在上升过程中粘附絮凝上浮。浮渣达到一定厚度时，由气浮罐顶部的刮泥机刮入泥渣池，大颗粒污泥沉如锥体，由排泥阀排入污泥池，污泥进一步浓缩后经添加高分子絮凝剂絮凝，脱水设备脱水，泥饼填埋或外运。
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