净化工程(净化车间)是在一定空间范围内，将空气中的微粒子、有害空气、细菌等污染物排除，并将室内温度、洁净度、压力、气流速度与气流分布、噪音振动及照明、静电控制在某一需求范围内的工程学科。净化工程所特别设计的房间，不论外在空气条件如何变化，室内均具有维持原先所设定要求之洁净度、温湿度及压力等性能。
无菌灌装车间进口处设置洗手池、给皂器，操作人员洗手、换鞋、洗脚后进入缓冲间，然后通过风淋室进入千级净化操作间。从取风口吸取的新风经加除湿系统、初效过滤、中效过滤，并经管道式空调制冷，臭氧杀菌后达到除湿降温杀菌；然后经高效送风口送达净化间，保证灌装区间的空气洁净度。无菌间及缓冲间的地面设环氧自流平地坪。(空间消毒采用紫外线消毒和臭氧消毒相结合的方式)